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书 书 书犐犆犛 65 . 020 . 01 犅 16 /G21 /G22 /G23 /G24 /G25 /G26 /G27 /G27 /G28 /G29 /G2A 犌犅 / 犜 36812 — 2018 /G21 /G22 /G23 /G24 /G25 /G26 /G27 /G28 /G29 /G2A /G2B /G2C /G2D /G2E /G2F /G30 犕狅犾犲犮狌犾犪狉犱犲狋犲犮狋犻狅狀犿犲狋犺狅犱狅犳 犘狅狋犪狋狅狔犲犾犾狅狑犱狑犪狉犳狏犻狉狌狊 2018 09 17 /G31 /G32 2019 04 01 /G33 /G34 /G27 /G28 /G2B /G2C /G2D /G2E /G2F /G30 /G31 /G32 /G21 /G27 /G27 /G28 /G29 /G2A /G33 /G2F /G30 /G34 /G35 /G36 /G31 /G32书 书 书前 言 本标准按照 GB / T1.1 — 2009 给出的规则起草 。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利 。 本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任 。 本标准由全国植物检疫标准化技术委员会 ( SAC / TC271 ) 提出并归口 。 本标准起草单位 : 中华人民共和国福建出入境检验检疫局 、 中华人民共和国福清出入境检验检疫局 、 福建农林大学 、 中国检验检疫科学研究院 。 本标准主要起草人 : 沈建国 、 蔡伟 、 高芳銮 、 张永江 、 陈细红 、 李敏 、 王宇 、 吴祖建 、 陈寿铃 。 Ⅰ 犌犅 / 犜 36812 — 2018 马铃薯黄矮病毒分子生物学检测方法 1 范围 本标准规定了马铃薯黄矮病毒 ( 犘狅狋犪狋狅狔犲犾犾狅狑犱狑犪狉犳狏犻狉狌狊 ) 的分子生物学检测方法 。 本标准适用于可能携带马铃薯黄矮病毒的植物及植物产品检疫鉴定 。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的 。 凡是注日期的引用文件 , 仅注日期的版本适用于本文件 。 凡是不注日期的引用文件 , 其最新版本 ( 包括所有的修改单 ) 适用于本文件 。 GB / T6682 分析实验室用水规格和试验方法 SN / T2122 进出境植物及植物产品检疫抽样 SN / T2964 植物病毒检测规范 SN / T3457 植物病毒分子生物学检测规范 3 马铃薯黄矮病毒基本信息 中文名 : 马铃薯黄矮病毒学名 : 犘狅狋犪狋狅狔犲犾犾狅狑犱狑犪狉犳狏犻狉狌狊 , 缩写 : PYDV 。 分类地位 : 弹状病毒科 ( 犚犺犪犫犱狅狏犻狉犻犱犪犲 )、 细胞核弹状病毒属 ( 犖狌犮犾犲狅狉犺犪犫犱狅狏犻狉狌狊 )。 马铃薯黄矮病毒的其他信息参见附录 A 。 4 方法原理 马铃薯黄矮病毒的分子生物学特性是制定本检测方法的主要依据 。 5 仪器 、 用具及试剂 5 . 1 仪器 高速冷冻离心机 、 电子天平 、 PCR 仪 、 荧光 PCR 仪 、 水平电泳系统 、 -20℃ 低温冰箱和 -80℃ 超低温冰箱 、 凝胶成像分析系统 、 pH 计 、 微波炉 、 磁力搅拌器 、 恒温水浴锅 、 高压灭菌锅 、 超净工作台等 。 5 . 2 用具 可调移液器 ( 2.5 μ L , 10 μ L , 20 μ L , 100 μ L , 200 μ L , 1000 μ L ) 和可调移液器枪头 、 离心管 、 研钵等 。 5 . 3 试剂 除另有规定外 , 所有试剂均为分析纯 , 实验用水应符合 GB / T6682 中相关规定 。 RTPCR 检测试剂见附录 B ; 实时荧光 RTPCR 检测试剂见附录 C 。 1 犌犅 / 犜 36812 — 2018 6 抽样和样品制备 6 . 1 抽样 尽量抽取有病毒危害症状的植物材料 , PYDV 的危害症状描述参见附录 A ; 抽样方法按照 SN / T2122 中规定执行 。 6 . 2 样品制备 分别按照有症和无症进行样品制备 , 具体方法按照 SN / T2964 和 SN / T3457 中规定执行 。 7 检测鉴定 7 . 1 犚犜犘犆犚 检测 以含 PYDV 材料作为阳性对照 , 以不含 PYDV 的健康植物组织作为阴性对照 , 同时以双蒸水代替模板作为空白对照 。 分别提取样品和对照的总 RNA , 反转录合成 cDNA 后进行 PCR 检测 , 具体操作见附录 B 。 如采用商品化一步法试剂盒 , 则按照试剂盒说明进行 。 7 . 2 实时荧光 犚犜犘犆犚 检测 以含 PYDV 材料作为阳性对照 , 以不含 PYDV 的健康植物组织作为阴性对照 , 同时以双蒸水代替模板作为空白对照 。 分别提取样品和对照的总 RNA , 反转录合成 cDNA 后进行实时荧光 PCR 检测 , 具体操作见附录 C 。 如采用商品化一步法试剂盒 , 则按照试剂盒说明进行 。 8 结果判定 样品检测时 , 检测流程及结果判定按下述原则进行 : ——— RTPCR 初步筛检 , 若检测结果为阴性 , 则判定样品不携带 PYDV ; 若检测结果为阳性 , 则采用 PCR 产物序列测定或实时荧光 RTPCR 进行验证 ; ——— 若验证结果为阳性 , 则判定样品携带 PYDV ; 若验证结果为阴性 , 则判定样品不携带 PYDV 。 9 样品保存与结果记录 9 . 1 样品保存 经检测确定携带 PYDV 的样品应保存在适合的条件下以备复核 。 种苗 、 叶片等样品保存在 -80℃ 冰箱中 ; 做好登记和标记工作 , 保存期限至少 1 年 。 9 . 2 结果记录 记录包括样品来源 、 种类 、 检测时间 、 地点 、 方法和结果 、 检测人员签字 。 RTPCR 检测应有电泳图片 ; 实时荧光 RTPCR 检测应有实时荧光结果图片 。 2 犌犅 / 犜 36812 — 2018 附 录 犃 ( 资料性附录 ) 马铃薯黄矮病毒相关资料 犃 . 1 寄主范围 已报道的寄主包括茄科 、 夹竹桃科 、 菊科 、 十字花科 、 唇形科 、 豆科 、 蓼科和玄参科植物 , 主要自然寄主为马铃薯 ( 犛狅犾犪狀狌犿狋狌犫犲狉狅狊狌犿 )。 犃 . 2 病害症状 侵染马铃薯引起病株矮缩 、 黄化 , 茎的生长点早期坏死等症状 ( 见图 A.1 )。 注 : 引自 CornellUniversity , Bugwood.org 。 图 犃 . 1 犘犢犇犞 侵染马铃薯引起的症状 犃 . 3 分布地区 主要分布于加拿大 、 美国 。 犃 . 4 传播途径 主要经昆虫介体叶蝉 犃犮犲狉犪狋犪犵犪犾犾犻犪狊犪狀犵狌犻狀狅犾犲狀狋犪 、 犃犮犲狉犪狋犪犵犪犾犾犻犪 sp . 、 犃犵犪犾犾犻犪犮狅狀狊狋狉犻犮狋犪 传播 , 也可通过带毒种薯 、 块茎远距离传播 。 犃 . 5 粒体形态 病毒粒体有包膜 , 杆菌状或子弹状 , 大小约 380nm×75nm 。 3 犌犅 / 犜 36812 — 2018 犃 . 6 病毒基因组 负义单链 RNA 病毒 , 全长约 12875bp 。 4 犌犅 / 犜 36812 — 2018 附 录 犅 ( 规范性附录 ) 犚犜犘犆犚 检测 犅 . 1 试剂 犅 . 1 . 1 Trizol 裂解液 。 犅 . 1 . 2 5×TBE 缓冲液 : Tris 碱 54.0g 硼酸 ( H 3 BO 3 ) 27.5g0.5mol / LEDTA ( pH8.0 ) 20mL 补充蒸馏水至 1L 。 用时加蒸馏水稀释至 0.5×TBE 。 犅 . 1 . 3 三氯甲烷 。 犅 . 1 . 4 异丙醇 。 犅 . 1 . 5 75% 乙醇 。 犅 . 1 . 6 无水乙醇 。 犅 . 1 . 7 RT 缓冲液 。 犅 . 1 . 8 dNTPs : 10mmol / L 。 犅 . 1 . 9 MMLVRT : 200U / μ L 。 犅 . 1 . 10 RNasin : 40U / μ L 。 犅 . 1 . 11 犜犪狇 PCRmix 。 犅 . 1 . 12 引物序列 : 根据已报道的 PYDV 基因组序列设计 1 对用于特异性扩增的引物 。 正向引物 PYDVF : 5′ATATTCATTTCCAGGCTTGCAT3′ 反向引物 PYDVR : 5′CTATTTTCCCCTCAGTAGTCCAC3′PCR 产物大小 588bp 。 犅 . 2 犚犜犘犆犚 检测 犅 . 2 . 1 总 犚犖犃 提取 取 0.1g 样品组织置于研钵中 , 加入液氮充分研磨至粉末状后迅速移入 1.5mL 离心管 , 再加入 1mLTrizol 裂解液 , 剧烈震荡摇匀 3min ; 4℃ , 12000 犵 离心 10min , 取上清液 ; 加入三氯甲烷 300 μ L , 剧烈震荡 15s , 室温静置 5min , 4℃ , 12000 犵 离心 15min , 取上层水相 ; 加入等体积的异丙醇 , 颠倒混匀后室温下静置 15min , 4℃ , 12000 犵 离心 10min , 弃上清液 ; 加入 1mL75% 的乙醇洗涤沉淀 2 次 , 每次 4℃ , 7500 犵 离心 3min , 弃上清液 ; RNA 沉淀干燥后 , 用 20 μ L ~ 40
GB-T 36812-2018 马铃薯黄矮病毒分子生物学检测方法
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